論文読解演習
このカテゴリで学ぶこと
- 論文のTitle、Abstract、Introduction、Methods、Results、Discussionの役割を区別できる
- Figure、Results、Methods、Discussionを行き来し、主張をデータに戻して確認できる
- PubMed、PMC、DOI、レビュー論文、原著論文を、論文を探す・選ぶ場面で使い分けられる
- 架空ケース演習を通じて、実験条件、Figure、限界を確認しながら論文を読める
論文読解演習は、ここまで学んだ生命科学の基礎、実験手法、統計、Figure読解を使って、論文を読む練習をするカテゴリです。最初から全文を精読するのではなく、論文の構造をつかみ、FigureとResultsを見て、必要なMethodsやDiscussionへ戻る読み方を身につけます。
順番に身につけたい場合は 論文を読む を使います。このページでは、いま読んでいる論文のどこで止まったか、または何を練習したいかからセクションを選びます。
セクション一覧
Section titled “セクション一覧”論文読解演習は、論文の構成、読む手順、論文探索、架空ケース演習に分かれています。各カードから、記事一覧の該当セクションへ移動できます。
論文の構成を読む
Title、Abstract、Introduction、Methods、Results、Discussionの役割を確認し、論文全体の地図を作ります。
読み方論文を読む手順
初回読み、Figureから読む方法、MethodsやDiscussionへの戻り方を整理し、読み進め方を決めます。
探索論文を探す・選ぶ
PubMed、PMC、DOI、レビュー論文と原著論文、Referencesを確認し、読む論文を選ぶ前提を作ります。
演習論文読解演習
RNA-seq、single-cell、Western blot、免疫染色、がんゲノム、CRISPRの架空ケースで読み方を練習します。
論文読解に慣れていない場合は、まず論文の構成を押さえ、次に読む手順を確認します。その後、読む論文を探す・選ぶ記事を使い、最後に架空ケース演習でMethods、Figure、Discussionを行き来する練習をします。
論文の構成を読む
Section titled “論文の構成を読む”- 生命科学論文の構成
未学習
論文読解演習
生命科学論文をTitle、Abstract、Introduction、Results、Methods、Discussionに分けて読む基本を説明します。
- TitleとAbstractの読み方
未学習
論文読解演習
論文のTitleとAbstractから、研究の問い、対象、方法、主な結論をつかむ読み方を説明します。
- Introductionの読み方
未学習
論文読解演習
Introductionから研究背景、未解決の問い、この論文の目的を拾う読み方を説明します。
- Resultsの読み方
未学習
論文読解演習
ResultsをFigureと対応づけながら、何が示され、何がまだ言えないかを読む方法を説明します。
- Methodsの読み方
未学習
論文読解演習
生命科学論文のMethodsで、サンプル、実験条件、解析、統計を確認する読み方を説明します。
- Discussionの読み方
未学習
論文読解演習
Discussionで著者の解釈、限界、今後の課題を分けて読む方法を説明します。
- Referencesの読み方
未学習
論文読解演習
Referencesから先行研究、レビュー論文、原著論文、次に読む文献を探す方法を説明します。
論文を読む手順
Section titled “論文を読む手順”- 論文を最初に読む手順
未学習
論文読解演習
生命科学論文を最初に読むときに、Title、Abstract、Figure、Results、Methodsをどの順に確認するかを説明します。
- Figureから論文を読む方法
未学習
論文読解演習
Figureを入口にして、Results、Methods、Discussionへ戻りながら論文を読む方法を説明します。
- Methods確認チェックリスト
未学習
論文読解演習
論文Methodsでサンプル、対照、反復、測定、解析、統計を確認するためのチェックリストを説明します。
- 論文を批判的に読む
未学習
論文読解演習
論文の主張を否定するのではなく、証拠、限界、代替説明、再現性を確認しながら読む方法を説明します。
- 論文ノートの取り方
未学習
論文読解演習
論文を読んだあとに、問い、方法、Figure、主張、限界、次に調べることを整理するノートの取り方を説明します。
論文を探す・選ぶ
Section titled “論文を探す・選ぶ”- PubMedの使い方
未学習
論文読解演習
PubMedで生命科学・医学系論文を探し、Title、Abstract、論文種別、本文リンクを確認する基本を説明します。
- PMC論文の探し方
未学習
論文読解演習
PMCで本文が公開されている論文を探し、Figure、Methods、Resultsへ進む基本を説明します。
- DOIとは何か
未学習
論文読解演習
DOIが論文やデータなどの恒久的な識別子として使われる理由と、論文読解での確認ポイントを説明します。
- レビュー論文と原著論文の違い
未学習
論文読解演習
レビュー論文と原著論文の目的、読み方、FigureやMethodsの確認ポイントの違いを説明します。
- 最初に読む論文の選び方
未学習
論文読解演習
初学者が読む論文を選ぶときに、テーマ、論文種別、Figureの読みやすさ、Methodsの前提を確認する方法を説明します。
論文読解演習
Section titled “論文読解演習”- 論文読解演習 - RNA-seq論文
未学習
論文読解演習
架空のRNA-seq論文を題材に、Abstract、Figure、Methods、Resultsを行き来して読む練習をします。
- 論文読解演習 - single-cell解析論文
未学習
論文読解演習
架空のsingle-cell解析論文を題材に、UMAP、クラスタ、マーカー遺伝子、差次的発現、Methodsを行き来して読む練習をします。
- 論文読解演習 - Western blotを含む論文
未学習
論文読解演習
架空のWestern blot論文を題材に、バンド、ローディングコントロール、定量、Methods確認をつなげて読む練習をします。
- 論文読解演習 - 免疫染色を含む論文
未学習
論文読解演習
架空の免疫染色論文を題材に、代表画像、局在、対照、定量、Methods確認をつなげて読む練習をします。
- 論文読解演習 - がんゲノム論文
未学習
論文読解演習
架空のがんゲノム論文を題材に、Tumor-normal比較、変異、コピー数変異、Methods確認をつなげて読む練習をします。
- 論文読解演習 - CRISPR論文
未学習
論文読解演習
架空のCRISPR論文を題材に、編集確認、対照、表現型、レスキュー実験、Methods確認をつなげて読む練習をします。
つまずいたら戻る
Section titled “つまずいたら戻る”Figureの読み方で止まった場合は 論文Figureの読み方 に戻ります。実験条件や対照で止まった場合は 実験手法 を確認します。p値、n数、反復、限界の読み方で止まった場合は 統計・研究デザイン に戻ります。論文を読む順番から練習したい場合は 論文を読む を使います。