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RNA-seqとは | BioLearn

RNAシーケンス

RNA sequencing

RNA-seq

RNA-seqは、RNAを配列として読み、どの遺伝子がどれくらい発現しているかを調べる手法です。

RNA-seqでは、細胞や組織からRNAを取り出し、シーケンサーで読める形にして配列を読みます。得られたリードをゲノムや転写産物に対応づけ、遺伝子ごとの発現量を推定します。

RNA-seqはシーケンシングNGSを使う代表的な解析です。結果を理解するには、実験設計、データ品質、正規化、統計解析の考え方も必要です。

RNA-seqは、細胞の状態を遺伝子発現の観点から調べる強力な入口です。条件間の違いを調べる差次的発現解析にもつながります。

  • RNA: RNA-seqで調べる分子。
  • NGS: RNA-seqでよく使われる配列決定技術。
  • 差次的発現解析: 条件間で発現量に差があるかを調べる解析。

差次的発現解析とは何か で、RNA-seqデータを条件比較に使う流れを学べます。