ペース	目安	向いている人
ゆっくり	1日1記事、約4週間	高校生物を学び直したい人
標準	1日2〜3記事、約2週間	生命科学の全体像を早めにつかみたい人
集中	週末にまとめて読む	情報系エンジニアで概念の地図がほしい人

学習の入口

この領域で確認すること

BioLearn の目的、使い方、学習順を確認します。分野別に探すのか、目的別に順番に学ぶのかを選びます。

主な入口

次に進む場所

はじめて学ぶ場合は基礎から学ぶへ進みます。特定の目的がある場合は、下の分野別カテゴリから直接入っても構いません。

生命科学の基礎

この領域で学ぶこと

論文を読む前提になる共通語彙を作ります。分子、細胞、組織、個体、DNA、RNA、タンパク質、遺伝子、ゲノムを混同せず、生命科学の文章で何が話題になっているかを見分けられるようにします。前提になる階層を先に押さえ、その後に遺伝情報、ゲノム、論文読解に必要な基本概念へ進みます。

読む記事一覧

この領域を終えるとできること

分子、細胞、組織、個体の階層を区別できる
DNA、RNA、タンパク質、遺伝子、ゲノム、染色体を区別できる
遺伝子発現、変異、表現型、モデル生物、生命科学の問いを、Figureや論文を読む入口として説明できる
細胞を生命現象の基本単位として位置づけられる
分子生物学、細胞生物学、ゲノミクス、バイオインフォマティクスがつながった学習領域だと理解できる

分子生物学

この領域で学ぶこと

DNA、RNA、タンパク質を、情報の保存、読み出し、働きの流れとして学びます。セントラルドグマ、転写、翻訳、遺伝子発現を整理し、RNA-seq や発現解析へ進む土台を作ります。

読む記事一覧

この領域を終えるとできること

転写と翻訳が、遺伝情報からタンパク質へ向かう流れのどこにあるか説明できる
遺伝子発現を、細胞の状態や実験データと結びつけて考えられる
RNA-seq の「発現量」が何を手がかりにした言葉なのか見通せる

細胞生物学

この領域で学ぶこと

分子の働きが、細胞という場所でどう機能として現れるのかを学びます。細胞膜、細胞小器官、細胞シグナル伝達を通して、外からの刺激、受容体、タンパク質、遺伝子発現のつながりを整理します。

読む記事一覧

この領域を終えるとできること

細胞膜が、細胞の内外を分けるだけでなく情報の入口にもなることを説明できる
細胞小器官を、分子が働く場所として捉えられる
シグナル伝達と遺伝子発現の変化をつなげて考えられる

ゲノミクス

この領域で学ぶこと

遺伝情報を、単一の遺伝子だけでなくゲノム全体として捉えます。ゲノム、染色体、遺伝的変異、ゲノムブラウザを通して、配列情報を広い文脈で読みます。

読む記事一覧

この領域を終えるとできること

遺伝子、ゲノム、染色体を混同せずに説明できる
遺伝的変異を、ゲノム配列の違いとして捉えられる
ゲノムブラウザ図や変異図を読むための位置づけを持てる

実験手法

この領域で学ぶこと

論文 Figure や Methods に出てくる実験が、何を測り、どんな結果として示されるのかを確認します。手順を細かく暗記するより、測定対象、対照、限界を押さえます。

読む記事一覧

この領域を終えるとできること

実験が測っている対象を、DNA、RNA、タンパク質、細胞のどれかに戻して考えられる
陽性対照、陰性対照、ローディングコントロールを確認できる
Figure legend に出てくる手法名から、結果の読み方を推測できる

バイオインフォマティクス

この領域で学ぶこと

生命科学データ解析の Figure を読むために、シーケンスデータ、RNA-seq、差次的発現解析、single-cell解析の基本を学びます。

読む記事一覧

この領域を終えるとできること

RNA-seq と差次的発現解析の関係を説明できる
カウント行列、クラスタリング、UMAP を single-cell 解析の流れとして捉えられる
Volcano plot、ヒートマップ、UMAP / t-SNE を読む前提を持てる

統計・研究デザイン

この領域で学ぶこと

Figure や Methods に出てくる統計表示、反復、対照、バイアスを読みます。p値だけで判断せず、効果量、ばらつき、サンプルサイズ、研究の限界を確認します。

読む記事一覧

この領域を終えるとできること

Figure の平均、ばらつき、n数、p値を分けて確認できる
統計的有意性と生物学的重要性を混同しにくくなる
論文の限界やバイアスを、主張を読むときの確認点として扱える

論文Figureの読み方

この領域で学ぶこと

生命科学論文の Results に出てくる主要な Figure を、見た目だけで判断せず、軸、条件、サンプル数、ばらつき、コントロール、統計表示を確認しながら読む練習をします。

読む記事一覧

この領域を終えるとできること

Figure legend、軸、条件、コントロール、ばらつきを確認できる
実験 Figure とオミクス Figure の読み方を分けて考えられる
Results セクションの主張を、Figure のどの部分が支えているか確認できる

論文読解演習

この領域で学ぶこと

Figure を読む練習のあとに、論文全体の構造、Methods、Results、Discussion を行き来する読み方へ進みます。論文を最初から訳すのではなく、研究の問い、主要 Figure、実験条件、結果の範囲、Discussion の解釈を分けて確認します。

読む記事一覧

この領域を終えるとできること

論文の各セクションの役割を説明できる
Figure の主張を Methods と Results に戻して確認できる
Discussion の解釈と、データから直接言えることを分けて読める

リファレンス

この領域で使うもの

学習中に参照する辞書、早見表、外部リソース、サイト情報をまとめています。順番に読む場所というより、迷ったときに戻る場所です。

主な入口

目的別ルート

目的がはっきりしている場合は、次の入口から始めても構いません。

高校生物を学び直したい

生命科学とは何かから順番に読みます。各記事の確認問題で説明できない用語があれば、用語集に戻ります。

分子生物学を先に学びたい

DNAとは何かから遺伝子発現とは何かまでを読みます。その後、細胞生物学へ進むと、分子がどこで働くかを理解しやすくなります。

バイオインフォマティクスに進みたい

いきなりRNA-seqへ進まず、遺伝子発現とは何かとバイオインフォマティクスとは何かを読んでから RNA-seqとは何かに進みます。差次的発現解析へ進む前に、ゲノムとは何かも読んでおくと位置づけが安定します。

順番に進みたい場合は、オミクス解析を読むを使います。ゲノム、変異、RNA-seq、single-cell解析、解析Figureを一つの流れとして確認できます。

Methodsと統計表示を確認したい

実験・統計を確認するを使います。対照、反復、n数、エラーバー、p値、効果量、基本的な実験手法をMethodsやFigure legendの確認点として並べています。

論文Figureを読みたい

まず Figureを読めるようになるを使います。分野別に探す場合は、実験手法、バイオインフォマティクス、統計・研究デザイン、論文Figureの読み方を行き来します。Figureの前提で詰まる場合は、実験・統計を確認するやオミクス解析を読むに戻ります。

論文全体を読めるようになりたい

先に Figure と Methods に戻る感覚を作り、その後論文を読めるようになるへ進みます。読む論文を探すところから始めたい場合は、読む論文の選び方と PubMedとは何かを使います。

学習チェック

次の問いに自分の言葉で答えられれば、ロードマップの土台はできています。

DNA、遺伝子、ゲノム、染色体の違いは何ですか。
転写と翻訳はどちらが先に起こりますか。
遺伝子発現は細胞の状態とどう関係しますか。
PCR、qPCR、NGS、Western blot は、それぞれ何を測る手法ですか。
RNA-seqでは何を測っていると言えますか。
差次的発現解析の結果を見るとき、p値以外に何を確認しますか。
論文Figureを読むとき、軸、条件、コントロール、ばらつきのうち何を最初に確認しますか。
論文のDiscussionで述べられた解釈を、どのFigureやMethodsに戻って確認しますか。

次に進む

ロードマップを読み終えたら、ラーニングパスから今の目的に合う順路を選びます。特定の図表を確認したい場合は論文Figureの読み方、論文全体の読み方を練習したい場合は論文を読めるようになる、言葉を確認したい場合は用語集を行き来します。