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シーケンシングとは | BioLearn

シーケンシング、配列決定

sequencing

シーケンシングは、DNAやRNA由来の塩基配列を読み取る技術です。

シーケンシングでは、DNAやRNA由来の分子を処理し、A、T、G、Cなどの塩基の並びとして読み取ります。RNAを読む場合も、多くの手法ではRNAをDNAに変換してから読みます。

現代の生命科学では、1本ずつ読む古典的な方法だけでなく、多数の断片を並列に読むNGSが広く使われます。得られた短い配列断片はリードと呼ばれ、バイオインフォマティクスで解析されます。

シーケンシングは、ゲノム配列、遺伝的変異、SNP、RNA-seqなどの多くのデータの出発点です。実験で得た配列をどう解釈するかには、データ品質や解析方法の理解も必要です。

  • PCR: 特定のDNA領域を増やす方法。
  • NGS: 多数の配列断片を並列に読むシーケンシング技術。
  • シーケンスデータ: シーケンシングで得られた配列データ。

RNA-seqとは何か で、シーケンシングが遺伝子発現解析にどう使われるかを見てみましょう。