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シーケンスデータとは | BioLearn

シーケンスデータ

sequence data

シーケンスデータは、DNAやRNA由来の塩基配列を読み取って得られるデータです。

シーケンシングNGSでは、A、T、G、Cなどの塩基の並びがデータとして出力されます。NGSでは、多数の短い配列断片であるリードが得られます。

シーケンスデータには、配列そのものだけでなく、読み取りの信頼度を示す品質スコアなども含まれることがあります。解析では、品質確認やマッピングが重要になります。

ゲノム解析、遺伝的変異の解析、RNA-seqなどは、シーケンスデータを出発点にします。データの性質を理解すると、解析結果を過度に単純化せずに読めます。

  • シーケンシング: 配列を読み取る技術。
  • NGS: 大量の配列を並列に読む技術。
  • リード: シーケンサーから得られる短い配列断片。

シーケンスデータとは何か で、リードや品質スコアの基本を確認しましょう。