Hi-Cとは | BioLearn

日本語名

Hi-C

英語名

Hi-C

略語

Hi-C

まず一言でいうと

Hi-Cは、ゲノム領域どうしの核内での近さを、接触頻度としてゲノム全体で測る手法です。

もう少し詳しく

Hi-Cの結果は、ゲノム上の領域どうしの組み合わせを行列やヒートマップとして表します。接触頻度が高いことは近接の手がかりですが、直接の機能を証明するものではありません。

なぜ重要か

3Dゲノム、クロマチンループ、染色体領域のまとまりを読むための代表的な方法です。

よく混同される用語

• 3Dゲノム: 核内でのゲノム配置を考える概念。
• ゲノム座標: 配列上の位置。
• ChIP-seq: 特定のタンパク質やヒストン修飾を対象にする手法。

関連する用語

• 染色体
• クロマチン
• ゲノムブラウザ

関連する教材ページ

• 3Dゲノムとは何か
• 染色体とは何か
• ゲノム座標とは何か

次に読む記事

3Dゲノムとは何か に進むと、Hi-Cで見える接触頻度の読み方を学べます。