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3Dゲノムとは | BioLearn

3Dゲノム

three-dimensional genome

3Dゲノムは、ゲノム配列が核内でどのように折りたたまれ、近接して配置されるかを見る考え方です。

ゲノム上では遠い領域どうしが、核内では近くにあることがあります。こうした近さは、遺伝子発現制御やクロマチン状態を考える手がかりになります。

ゲノムを一次元の配列としてだけでなく、核内の空間配置として読む入口になります。

  • ゲノム座標: 配列上の位置。
  • クロマチン: DNAとタンパク質からなる核内構造。
  • Hi-C: ゲノム領域どうしの接触頻度を測る手法。

ゲノムブラウザとは何か に進むと、ゲノム上の位置情報を重ねて読む基本を学べます。