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ゲノム座標とは | BioLearn

ゲノム座標

genomic coordinate

ゲノム座標は、染色体名と位置を使って、ゲノム上の場所を表す表記です。

たとえば「chr1のある範囲」のように、リファレンスゲノム上の場所を指定します。ゲノムブラウザ、バリアント解析、アノテーションの対応づけでは、どの座標系を使っているかが重要です。

同じ遺伝子名でも、見たい領域や使うリファレンスのバージョンによって座標の表記が変わることがあります。論文やデータを比較するときは、染色体名、開始位置、終了位置、リファレンスを確認します。

ゲノム座標とは何か へ進むと、ゲノム上の位置をどう読むかを学べます。