ゲノムブラウザとは | BioLearn
ゲノムブラウザ
genome browser
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”ゲノムブラウザは、ゲノム上の座標に沿って、遺伝子、変異、リード、注釈情報などを重ねて表示する画面です。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”ゲノムブラウザでは、染色体上の位置を基準に、複数の情報をトラックとして並べます。遺伝子の構造、遺伝的変異の位置、シーケンスリード、ピーク、保存性などを同じ領域に重ねて確認できます。
ただし、同じ位置に見えることは研究の手がかりであり、それだけで機能や原因を証明するものではありません。表示範囲、ゲノムアセンブリ、トラックの種類、サンプル、縦軸のスケールを合わせて読みます。
ゲノムブラウザは、ゲノム上の位置関係を目で確認するための基本的な道具です。論文では、特定領域のリード分布、ピーク、変異、遺伝子構造を示すFigureとしてよく出てきます。
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Section titled “次に読む記事”ゲノムブラウザ図の読み方 で、論文Figureとして読むときの確認点へ進みましょう。