ChIP-seqとは | BioLearn

日本語名

ChIP-seq

英語名

chromatin immunoprecipitation sequencing

略語

ChIP-seq

まず一言でいうと

ChIP-seqは、特定のタンパク質やヒストン修飾が多く検出されるゲノム領域を調べる手法です。

もう少し詳しく

抗体で目的分子を含むクロマチン断片を濃縮し、そのDNA配列を読みます。解析では、背景よりシグナルが高い領域をピークとして検出します。

なぜ重要か

転写因子結合、ヒストン修飾、調節領域候補をゲノム座標上で読むためによく使われます。

よく混同される用語

• ATAC-seq: 開いたクロマチン領域を調べる手法。
• RNA-seq: RNA量を測る手法。
• ヒストン修飾: ChIP-seqで対象にできる修飾の一つ。

関連する用語

• クロマチン
• 転写因子
• ゲノムブラウザ

関連する教材ページ

• ChIP-seqとは何か
• ヒストン修飾とは何か
• 転写因子とは何か

次に読む記事

ゲノムブラウザとは何か に進むと、ChIP-seqピークをゲノム座標上で読む方法を学べます。