Pathway enrichmentとは | BioLearn
パスウェイエンリッチメント
pathway enrichment
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”Pathway enrichmentは、遺伝子リストやランキングに、特定の経路に属する遺伝子が偏って含まれるかを見る解析です。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”差次的発現解析などで得られた遺伝子リストを、経路や機能カテゴリのまとまりとして読み直すために使われます。
経路名は結果の全体像をつかむ手がかりになりますが、入力遺伝子、背景集合、データベース、FDRを確認しないと解釈を広げすぎることがあります。
よく混同される用語
Section titled “よく混同される用語”- GSEA: 遺伝子ランキング全体を使う代表的なエンリッチメント解析です。
- 遺伝子セット: 経路や機能などでまとめた遺伝子の集合です。
関連する用語
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Section titled “次に読む記事”Pathway enrichmentとは何か で、解析条件と読み方を確認しましょう。