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エンリッチメントとは | BioLearn

エンリッチメント

enrichment

エンリッチメントは、ある特徴や遺伝子セットが期待より多く含まれるかを見る考え方です。

遺伝子リストの中に特定の経路や機能に関わる遺伝子が偏って多いかを調べるときに使われます。

解析に使った遺伝子リスト、背景集合、補正方法によって結果が変わるため、過度に広く解釈しないことが大切です。

  • GSEA: ランキングされた遺伝子全体を使う代表的なエンリッチメント解析です。
  • パスウェイ: エンリッチメントで検出される遺伝子セットの一例です。

Pathway enrichment plotの読み方 へ進むと、エンリッチメントを実際の教材文脈で確認できます。