GSEAとは | BioLearn
GSEA
gene set enrichment analysis
GSEA
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”GSEAは、遺伝子セットが条件間の変化に偏って現れるかを調べる解析です。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”単一遺伝子ではなく、経路や機能に関係する遺伝子の集合として変化を見ます。
GSEA plotでは、遺伝子セットの定義、ランキング方法、補正後p値、解釈の範囲を確認します。
よく混同される用語
Section titled “よく混同される用語”- エンリッチメント: 特定の機能や経路に関わる遺伝子が偏って多いかを見る考え方です。
- 差次的発現解析: 個々の遺伝子の条件間差を調べる解析です。
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