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Lollipop plotとは | BioLearn

Lollipop plot

lollipop plot

Lollipop plotは、遺伝子、タンパク質、ゲノム領域などの位置に沿って、変異やイベントを棒と丸で示す図です。

横軸に位置、丸の大きさや色に頻度や種類を示すことがあります。タンパク質ドメインやゲノム上の領域と重ねて読むことが多いです。

変異がどこに集まっているかを見やすくします。ただし、位置や頻度だけで機能への影響を断定しません。

  • バリアント: 参照配列や基準と比べて見つかる配列上の違いです。
  • タンパク質ドメイン: タンパク質の中でまとまった機能や構造を持つ領域です。

Lollipop plotの読み方 で、位置、頻度、凡例の確認へ進みましょう。