Lollipop plotとは | BioLearn
Lollipop plot
lollipop plot
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”Lollipop plotは、遺伝子、タンパク質、ゲノム領域などの位置に沿って、変異やイベントを棒と丸で示す図です。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”横軸に位置、丸の大きさや色に頻度や種類を示すことがあります。タンパク質ドメインやゲノム上の領域と重ねて読むことが多いです。
変異がどこに集まっているかを見やすくします。ただし、位置や頻度だけで機能への影響を断定しません。
よく混同される用語
Section titled “よく混同される用語”- バリアント: 参照配列や基準と比べて見つかる配列上の違いです。
- タンパク質ドメイン: タンパク質の中でまとまった機能や構造を持つ領域です。
関連する用語
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Section titled “次に読む記事”Lollipop plotの読み方 で、位置、頻度、凡例の確認へ進みましょう。