リファレンスゲノムとは | BioLearn
リファレンスゲノム
reference genome
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”リファレンスゲノムは、配列解析やゲノム表示で基準として使う代表的なゲノム配列です。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”実験で得た配列は、リファレンスゲノムに対応づけることで、どの染色体のどの位置に由来するかを考えやすくなります。リファレンスは「その生物の完全な一個体」ではなく、解析の座標系として使う標準的な配列です。
同じデータでも、使うリファレンスゲノムやバージョンが変わると、座標や注釈との対応が変わることがあります。論文やデータベースを読むときは、どのリファレンスを使ったかを確認します。
よく混同される用語
Section titled “よく混同される用語”- ゲノム: ある生物が持つ遺伝情報の全体。
- ゲノム座標: リファレンス上の位置を表す表記。
- ゲノムアノテーション: リファレンス上の領域に意味づけを加えた情報。
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