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CNV plotとは | BioLearn

CNV plot

copy number variation plot

CNV plot

CNV plotは、ゲノム上の位置に沿ってDNA領域のコピー数が増えているか減っているかを示す図です。

染色体位置、基準線、セグメント、ノイズ、サンプル比較を合わせて読みます。点の揺れだけでなく、連続した領域として変化しているかを確認します。

コピー数変異の候補領域を視覚的に確認できます。ただし、解析方法、データ品質、比較対象を見ずに意味を断定しません。

  • コピー数変異: ゲノム領域のコピー数が増減する変化です。
  • ゲノム座標: ゲノム上の位置を表す表記です。

CNV plotの読み方 で、基準線、方向、領域幅を順に確認しましょう。