Volcano plotとは | BioLearn
Volcano plot
volcano plot
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”Volcano plotは、差の大きさと統計的な強さを同時に示す散布図です。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”差次的発現解析などで、横軸にfold change、縦軸にp値や補正後p値を置くことが多いです。日本語ではボルケーノプロットとも書かれますが、BioLearnでは記事本文の表記をVolcano plotに統一します。
点の位置だけでなく、しきい値、多重検定補正、効果量、生物学的な意味を合わせて読みます。
よく混同される用語
Section titled “よく混同される用語”- 散布図: 2つの変数を点で示す一般的なグラフです。
- p値: Volcano plotの縦軸に使われることがあります。
関連する用語
Section titled “関連する用語”関連する教材ページ
Section titled “関連する教材ページ”次に読む記事
Section titled “次に読む記事”Volcano plotの読み方 へ進むと、Volcano plotを実際の教材文脈で確認できます。