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ピークとは | BioLearn

ピーク

peak

ピークは、シーケンス解析やグラフで信号が周囲より高く集まる領域を指します。

ChIP-seqやATAC-seqでは、リードが集まるゲノム領域をピークとして検出することがあります。

ピークは結合や開いたクロマチンの候補を示しますが、検出条件、背景、再現性を確認して解釈します。

  • バンド: ゲルやWestern blotで帯状に見える信号です。
  • リード: ピークを作る元になる短い配列断片です。

ATAC-seqとは何か へ進むと、ピークを実際の教材文脈で確認できます。