カバレッジとは | BioLearn
カバレッジ
coverage
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”カバレッジは、シーケンシングで、ある領域がどれくらい読まれているかを表す指標です。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”リードが多く重なっている領域はカバレッジが高く、変異検出やメチル化解析などで信頼度を考える材料になります。
カバレッジが低い領域では、変異やシグナルを見落としたり、不確実に読んだりする可能性があります。
よく混同される用語
Section titled “よく混同される用語”- リード数: 全体または条件ごとの読まれた断片数です。カバレッジは領域ごとの読まれ方を表します。
- 発現量: RNA-seqでは読まれた数から推定されますが、同じ意味ではありません。
関連する用語
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Section titled “次に読む記事”シーケンスデータとは何か へ進むと、カバレッジを実際の教材文脈で確認できます。