クラスタリングとは | BioLearn
クラスタリング
clustering
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”クラスタリングは、似た特徴を持つデータ点を探索的にまとめる解析です。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”single-cell RNA-seqでは、発現パターンが似た細胞をクラスタとしてまとめることがあります。クラスタは、細胞型や細胞状態を考える入口になります。
ただし、クラスタ名は自動的に正解として出るものではありません。マーカー遺伝子、サンプル情報、既知の生物学的知識を合わせて解釈します。
クラスタリングは、UMAPやヒートマップの色分けとしてよく登場します。Figureを読むときは、クラスタ数、分け方、注釈の根拠を確認することで、見た目だけの解釈を避けやすくなります。
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Section titled “次に読む記事”マーカー遺伝子とは何か で、クラスタに意味づけをする根拠を学びましょう。