クラスターとは | BioLearn
クラスター
cluster
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”クラスターは、クラスタリングによって得られた、似た特徴を持つデータ点のまとまりです。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”single-cell RNA-seqでは、発現パターンが似た細胞が同じクラスターとしてまとめられることがあります。クラスターは、細胞型や細胞状態を考えるための入口になります。
ただし、クラスターは解析条件によって変わる探索的なまとまりです。クラスター名を解釈するときは、マーカー遺伝子や実験条件、既知の知識を合わせて確認します。
UMAPやヒートマップでは、クラスターごとに色分けされた図がよく登場します。Figureを読むときは、クラスターが何を根拠に分けられ、どのように注釈されたかを見ることが大切です。
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Section titled “次に読む記事”クラスタリングとは何か で、クラスターがどのように作られ、どう解釈されるかを確認しましょう。