アリル頻度とは | BioLearn
アリル頻度
allele frequency
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”アリル頻度は、あるアリルや変異がデータや集団の中でどれくらい見られるかを表す割合です。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”がんゲノム解析では、腫瘍サンプル中で変異を持つリードの割合として使われることがあります。集団遺伝学では集団内でのアリルの頻度を指します。
アリル頻度は腫瘍純度、コピー数、マッピング、サンプルの混ざり方に影響されるため、単独で意味を決めません。
よく混同される用語
Section titled “よく混同される用語”- 変異頻度: 文脈によって似た意味で使われますが、何を分母にしているかを確認します。
- コピー数変異: 変異の見え方に影響するゲノム領域の数の変化です。
関連する用語
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