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アラインメントとは | BioLearn

アラインメント

alignment

アラインメントは、配列同士の対応する位置をそろえて並べる処理です。

DNA、RNA、タンパク質配列を比べるとき、対応する文字の位置をそろえることで、似ている部分や違う部分を見やすくします。

配列の対応づけは、マッピング、相同性の比較、変異の検出など、多くの解析の前提になります。

  • マッピング: リードなどの配列を参照配列上の位置へ対応づける解析です。
  • リファレンスゲノム: 対応づけの基準として使う代表的なゲノム配列です。

マッピングとは何か で、リードを参照配列へ対応づける解析を確認しましょう。