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フローサイトメトリーの読み方
この記事で学ぶこと
- フローサイトメトリーFigureでゲートを確認できる
- 点の数と独立サンプル数を区別できる
- 陽性率や細胞集団の比較を読む順番を説明できる
フローサイトメトリーFigureは、細胞集団を点の分布とゲートで示すFigureです。細胞の性質やマーカー発現の違いを、集団として分けて読むために使われます。
読むときは、ゲートの中の割合だけに注目しません。どの対照を使ってゲートを引き、どの細胞集団を解析対象にしているかを確認します。
このFigureで何を見るか
Section titled “このFigureで何を見るか”このFigureでは、各点が何を表すか、どのゲートで集団を分けたか、陽性率がどの対照に基づくかを確認します。割合の数字を見る前に、解析対象の細胞集団がどう選ばれたかを追います。
図の構成要素
Section titled “図の構成要素”- 点または密度: 個々の細胞、または細胞の集まりを示します。
- 軸: 蛍光強度、散乱光、マーカー発現などを表します。
- ゲート: 解析対象に含める細胞集団の境界です。
- 陽性率: ゲート内の割合として示されることがあります。
- 対照: unstained、single stain、isotype、FMOなどが解釈の基準になります。
- 軸がどのマーカーや測定値を表すか確認します。
- どの細胞集団から解析が始まっているかを見ます。
- ゲートがどの対照を基準に引かれているか確認します。
- 陽性率や平均蛍光強度を読み、群間で比較します。
- 補足FigureやMethodsでゲーティング戦略を確認します。
実験の原理はフローサイトメトリーとは何かで確認します。対照の意味が曖昧な場合は、対照実験とFigure legendの読み方に戻ります。
よくある誤解
Section titled “よくある誤解”- ゲート内の割合だけを見て、ゲートの決め方を確認しない。
- 蛍光強度の差を、常にタンパク質量の差として単純に読む。
- 対照なしで陽性・陰性を判断する。
- 解析対象の細胞集団が変わっている可能性を見落とす。
確認問題
読み終えた内容を、1問ずつ選択式で確認します。
未回答
4問
最高記録なし 復習なし