インデックスとは | BioLearn
インデックス
index / sample barcode
まず一言でいうと
Section titled “まず一言でいうと”インデックスは、NGSでサンプルを識別するためにライブラリへ付ける短い配列です。
もう少し詳しく
Section titled “もう少し詳しく”複数サンプルをまとめてシーケンシングしたあと、インデックス配列を使ってどのリードがどのサンプル由来かを分けます。
インデックスの設計や扱いを誤ると、サンプルの取り違えや混ざり込みとして解析に影響します。
よく混同される用語
Section titled “よく混同される用語”- アダプター: シーケンサーで読むために核酸断片の端に付ける配列です。
- UMI: 元の分子を区別するために使う短い配列です。
関連する用語
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Section titled “関連する教材ページ”次に読む記事
Section titled “次に読む記事”ライブラリ調製とは何か へ進むと、インデックスを複数サンプル解析の文脈で確認できます。