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インデックスとは | BioLearn

インデックス

index / sample barcode

インデックスは、NGSでサンプルを識別するためにライブラリへ付ける短い配列です。

複数サンプルをまとめてシーケンシングしたあと、インデックス配列を使ってどのリードがどのサンプル由来かを分けます。

インデックスの設計や扱いを誤ると、サンプルの取り違えや混ざり込みとして解析に影響します。

  • アダプター: シーケンサーで読むために核酸断片の端に付ける配列です。
  • UMI: 元の分子を区別するために使う短い配列です。

ライブラリ調製とは何か へ進むと、インデックスを複数サンプル解析の文脈で確認できます。